MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus islandicus Y.N.15.51 plasmid pYN01

Total Repeats: 1054

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012624	TGA	2	6	21	26	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	228288720
2	NC_012624	A	6	6	32	37	100 %	0 %	0 %	0 %	228288720
3	NC_012624	CAT	2	6	90	95	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	228288720
4	NC_012624	T	6	6	95	100	0 %	100 %	0 %	0 %	228288720
5	NC_012624	CTA	2	6	143	148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	228288720
6	NC_012624	AGT	2	6	172	177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	228288720
7	NC_012624	TTC	2	6	197	202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	228288720
8	NC_012624	CAT	2	6	211	216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	228288720
9	NC_012624	ATA	2	6	266	271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288720
10	NC_012624	AAC	2	6	347	352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	228288720
11	NC_012624	GGAT	2	8	389	396	25 %	25 %	50 %	0 %	228288720
12	NC_012624	AT	3	6	403	408	50 %	50 %	0 %	0 %	228288720
13	NC_012624	ACA	2	6	416	421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	228288720
14	NC_012624	CAG	2	6	451	456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	228288720
15	NC_012624	ATA	3	9	458	466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288720
16	NC_012624	AGA	2	6	488	493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	228288720
17	NC_012624	AAAATC	2	12	506	517	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	228288720
18	NC_012624	ATA	2	6	545	550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288720
19	NC_012624	AAT	2	6	589	594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288720
20	NC_012624	CA	4	8	615	622	50 %	0 %	0 %	50 %	228288720
21	NC_012624	TATAC	2	10	665	674	40 %	40 %	0 %	20 %	228288720
22	NC_012624	AAT	2	6	679	684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288720
23	NC_012624	AGCA	2	8	685	692	50 %	0 %	25 %	25 %	228288720
24	NC_012624	CAT	2	6	712	717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	228288720
25	NC_012624	AAC	2	6	721	726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	228288720
26	NC_012624	AAC	2	6	751	756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	228288720
27	NC_012624	TAA	2	6	762	767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288720
28	NC_012624	ACTAGG	2	12	796	807	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	228288720
29	NC_012624	AAC	2	6	835	840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	228288720
30	NC_012624	AGG	2	6	892	897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	228288720
31	NC_012624	TAA	2	6	900	905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288720
32	NC_012624	AAT	2	6	922	927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288720
33	NC_012624	ATA	2	6	953	958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288720
34	NC_012624	AAT	2	6	964	969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288720
35	NC_012624	A	6	6	984	989	100 %	0 %	0 %	0 %	228288720
36	NC_012624	GGT	2	6	1025	1030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012624	TTC	2	6	1062	1067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	228288721
38	NC_012624	TTC	3	9	1088	1096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	228288721
39	NC_012624	CTAGT	2	10	1167	1176	20 %	40 %	20 %	20 %	228288721
40	NC_012624	GGT	2	6	1187	1192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	228288721
41	NC_012624	TAT	2	6	1197	1202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	228288721
42	NC_012624	ATTT	2	8	1208	1215	25 %	75 %	0 %	0 %	228288721
43	NC_012624	GAT	2	6	1234	1239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012624	TAA	2	6	1247	1252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012624	AGA	2	6	1308	1313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	228288722
46	NC_012624	ATC	2	6	1322	1327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	228288722
47	NC_012624	GAA	2	6	1359	1364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	228288722
48	NC_012624	GATA	2	8	1372	1379	50 %	25 %	25 %	0 %	228288722
49	NC_012624	GAA	2	6	1451	1456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	228288722
50	NC_012624	TAA	2	6	1462	1467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288723
51	NC_012624	TTTCA	2	10	1508	1517	20 %	60 %	0 %	20 %	228288723
52	NC_012624	ATT	2	6	1532	1537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	228288723
53	NC_012624	AT	3	6	1577	1582	50 %	50 %	0 %	0 %	228288723
54	NC_012624	AAC	2	6	1587	1592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	228288723
55	NC_012624	AAT	2	6	1604	1609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288723
56	NC_012624	ATA	2	6	1696	1701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288723
57	NC_012624	GAG	2	6	1811	1816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	228288723
58	NC_012624	TGA	2	6	1821	1826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	228288723
59	NC_012624	TCT	2	6	1845	1850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	228288724
60	NC_012624	TAC	2	6	1901	1906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	228288724
61	NC_012624	TTGA	2	8	1949	1956	25 %	50 %	25 %	0 %	228288724
62	NC_012624	TAT	3	9	2090	2098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	228288724
63	NC_012624	GGT	2	6	2140	2145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	228288724
64	NC_012624	GTT	2	6	2146	2151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	228288724
65	NC_012624	GTT	2	6	2171	2176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	228288724
66	NC_012624	AT	3	6	2219	2224	50 %	50 %	0 %	0 %	228288724
67	NC_012624	GGA	2	6	2244	2249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	228288724
68	NC_012624	TGC	2	6	2322	2327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	228288724
69	NC_012624	AGC	2	6	2329	2334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	228288724
70	NC_012624	ATT	2	6	2355	2360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	228288724
71	NC_012624	TAT	2	6	2366	2371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	228288724
72	NC_012624	ATA	3	9	2382	2390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012624	A	6	6	2407	2412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012624	GAT	2	6	2457	2462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012624	CTGAC	2	10	2503	2512	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_012624	TCT	2	6	2559	2564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_012624	ACG	2	6	2620	2625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_012624	TTCT	2	8	2666	2673	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_012624	TAT	2	6	2702	2707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012624	TAA	2	6	2712	2717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012624	GAG	2	6	2736	2741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012624	ATG	2	6	2746	2751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012624	TAA	2	6	2779	2784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012624	GAATT	2	10	2807	2816	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012624	ATT	2	6	2869	2874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012624	TAAAA	2	10	2901	2910	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012624	ATG	2	6	2914	2919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012624	AGA	2	6	2920	2925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012624	ATA	2	6	2938	2943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012624	TTTA	2	8	2952	2959	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012624	AGT	2	6	3005	3010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012624	T	6	6	3032	3037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012624	TAC	2	6	3075	3080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_012624	CTA	2	6	3093	3098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_012624	AGG	2	6	3135	3140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012624	TTA	2	6	3168	3173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012624	AATT	2	8	3244	3251	50 %	50 %	0 %	0 %	228288725
98	NC_012624	ATGGCT	2	12	3255	3266	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	228288725
99	NC_012624	GCT	2	6	3280	3285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	228288725
100	NC_012624	AAG	2	6	3324	3329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	228288725
101	NC_012624	GCT	2	6	3332	3337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	228288725
102	NC_012624	AAT	2	6	3368	3373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288725
103	NC_012624	AG	3	6	3407	3412	50 %	0 %	50 %	0 %	228288725
104	NC_012624	AGG	2	6	3433	3438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	228288725
105	NC_012624	TCAG	2	8	3553	3560	25 %	25 %	25 %	25 %	228288726
106	NC_012624	TTA	2	6	3645	3650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	228288726
107	NC_012624	TAG	2	6	3676	3681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	228288726
108	NC_012624	AG	3	6	3730	3735	50 %	0 %	50 %	0 %	228288726
109	NC_012624	AAAG	2	8	3793	3800	75 %	0 %	25 %	0 %	228288726
110	NC_012624	A	6	6	3826	3831	100 %	0 %	0 %	0 %	228288726
111	NC_012624	ATA	2	6	3900	3905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288726
112	NC_012624	TAT	2	6	3939	3944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	228288726
113	NC_012624	TAA	2	6	4012	4017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288726
114	NC_012624	A	6	6	4055	4060	100 %	0 %	0 %	0 %	228288726
115	NC_012624	TAG	2	6	4099	4104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	228288726
116	NC_012624	TAG	2	6	4110	4115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	228288726
117	NC_012624	ATT	2	6	4118	4123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	228288726
118	NC_012624	TA	3	6	4176	4181	50 %	50 %	0 %	0 %	228288726
119	NC_012624	AAAT	2	8	4230	4237	75 %	25 %	0 %	0 %	228288726
120	NC_012624	TAA	2	6	4282	4287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288726
121	NC_012624	TAA	2	6	4320	4325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288726
122	NC_012624	TAC	2	6	4470	4475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	228288726
123	NC_012624	A	7	7	4476	4482	100 %	0 %	0 %	0 %	228288726
124	NC_012624	ATA	2	6	4496	4501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288726
125	NC_012624	TAAA	2	8	4509	4516	75 %	25 %	0 %	0 %	228288726
126	NC_012624	CTA	3	9	4648	4656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_012624	CATAA	2	10	4676	4685	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_012624	TTCTAC	2	12	4686	4697	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_012624	AG	3	6	4816	4821	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012624	AT	3	6	4904	4909	50 %	50 %	0 %	0 %	228288727
131	NC_012624	CAA	2	6	4938	4943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	228288727
132	NC_012624	ATT	2	6	4953	4958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	228288727
133	NC_012624	AAG	2	6	4959	4964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	228288727
134	NC_012624	TAG	2	6	4966	4971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	228288727
135	NC_012624	TA	3	6	5026	5031	50 %	50 %	0 %	0 %	228288727
136	NC_012624	AGT	2	6	5132	5137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	228288727
137	NC_012624	TAC	2	6	5150	5155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	228288727
138	NC_012624	GTT	2	6	5169	5174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	228288727
139	NC_012624	TTTCG	2	10	5207	5216	0 %	60 %	20 %	20 %	228288727
140	NC_012624	GAA	2	6	5246	5251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	228288727
141	NC_012624	ATC	2	6	5255	5260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	228288727
142	NC_012624	ACAT	2	8	5262	5269	50 %	25 %	0 %	25 %	228288727
143	NC_012624	GAA	2	6	5277	5282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	228288727
144	NC_012624	GAA	2	6	5288	5293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	228288727
145	NC_012624	ATGAGG	2	12	5337	5348	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	228288727
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147	NC_012624	AGT	2	6	5486	5491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	228288727
148	NC_012624	GAA	2	6	5498	5503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	228288727
149	NC_012624	TA	3	6	5524	5529	50 %	50 %	0 %	0 %	228288727
150	NC_012624	CTAAGT	2	12	5545	5556	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	228288727
151	NC_012624	AAG	2	6	5594	5599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	228288727
152	NC_012624	ATA	2	6	5608	5613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288727
153	NC_012624	TCT	2	6	5638	5643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	228288727
154	NC_012624	ATA	2	6	5721	5726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288727
155	NC_012624	TGA	2	6	5731	5736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	228288727
156	NC_012624	AAG	2	6	5800	5805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	228288727
157	NC_012624	AAG	2	6	5935	5940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	228288727
158	NC_012624	GAG	2	6	5984	5989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	228288727
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163	NC_012624	TGA	2	6	6100	6105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	228288727
164	NC_012624	GAA	2	6	6119	6124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	228288727
165	NC_012624	TGA	2	6	6131	6136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	228288727
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170	NC_012624	TAAA	2	8	6346	6353	75 %	25 %	0 %	0 %	228288728
171	NC_012624	TAA	2	6	6356	6361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288728
172	NC_012624	CTT	2	6	6367	6372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	228288728
173	NC_012624	CTC	2	6	6377	6382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	228288728
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175	NC_012624	TCT	2	6	6470	6475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	228288729
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177	NC_012624	TCT	2	6	6564	6569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	228288729
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179	NC_012624	CT	3	6	6649	6654	0 %	50 %	0 %	50 %	228288729
180	NC_012624	GCT	2	6	6658	6663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	228288729
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182	NC_012624	AAGA	2	8	6816	6823	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
183	NC_012624	TC	3	6	7068	7073	0 %	50 %	0 %	50 %	228288730
184	NC_012624	TTA	2	6	7081	7086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	228288730
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240	NC_012624	A	7	7	9025	9031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
241	NC_012624	TAA	2	6	9070	9075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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243	NC_012624	T	6	6	9141	9146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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245	NC_012624	TCT	2	6	9173	9178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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248	NC_012624	TGTA	2	8	9251	9258	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
249	NC_012624	AAG	2	6	9337	9342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	228288737
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259	NC_012624	TAA	2	6	9533	9538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288737
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271	NC_012624	TAA	2	6	9907	9912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288738
272	NC_012624	CTA	2	6	9953	9958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	228288738
273	NC_012624	AG	3	6	9997	10002	50 %	0 %	50 %	0 %	228288738
274	NC_012624	AGG	2	6	10005	10010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	228288738
275	NC_012624	AAG	2	6	10013	10018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	228288738
276	NC_012624	ATG	2	6	10143	10148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	228288738
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279	NC_012624	AGG	2	6	10337	10342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	228288738
280	NC_012624	TAA	2	6	10371	10376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288738
281	NC_012624	AGG	2	6	10377	10382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	228288738
282	NC_012624	TCTA	2	8	10438	10445	25 %	50 %	0 %	25 %	228288738
283	NC_012624	GGAAGG	2	12	10584	10595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	228288738
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285	NC_012624	TGA	2	6	10738	10743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	228288738
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287	NC_012624	GGA	2	6	10776	10781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	228288738
288	NC_012624	AGG	2	6	10833	10838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	228288738
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290	NC_012624	CAT	2	6	11193	11198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_012624	AT	3	6	11203	11208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_012624	TTTA	2	8	11250	11257	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_012624	ATA	2	6	11288	11293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_012624	AG	3	6	11295	11300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
295	NC_012624	TGA	2	6	11392	11397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	228288739
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302	NC_012624	CTT	2	6	11680	11685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
303	NC_012624	TAT	2	6	11695	11700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
304	NC_012624	TTC	3	9	11718	11726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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337	NC_012624	CT	3	6	13120	13125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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370	NC_012624	TA	3	6	14114	14119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
371	NC_012624	AAAG	2	8	14127	14134	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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384	NC_012624	A	6	6	14520	14525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
385	NC_012624	AT	3	6	14584	14589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
386	NC_012624	TAA	2	6	14598	14603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
387	NC_012624	ATT	2	6	14608	14613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	228288745
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389	NC_012624	TATT	2	8	14713	14720	25 %	75 %	0 %	0 %	228288745
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400	NC_012624	TCT	2	6	15178	15183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	228288745
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403	NC_012624	TA	4	8	15315	15322	50 %	50 %	0 %	0 %	228288745
404	NC_012624	GAT	2	6	15364	15369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	228288745
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406	NC_012624	TAC	2	6	15433	15438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	228288745
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